基于癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)TCGA及SEER的信息挖掘技術(shù)培訓(xùn)2018 會(huì)議時(shí)間:2018-07-06 08:00至 2018-07-08 17:00結(jié)束 會(huì)議地點(diǎn):廣州 軍山酒店 越秀區(qū)廣園西路137號(hào) 會(huì)議規(guī)模:50人
身處大數(shù)據(jù)時(shí)代,對(duì)于從事腫瘤研究的臨床醫(yī)生或基礎(chǔ)科研人員,有沒(méi)有一種可以既不做實(shí)驗(yàn)又不查病史,直接調(diào)用公共數(shù)據(jù)撰寫(xiě)發(fā)表SCI論文的方法呢? TCGA和SEER等癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)即提供了這樣一種可能。TCGA(癌癥基因組圖譜)數(shù)據(jù)庫(kù)包括常見(jiàn)癌癥的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀遺傳組數(shù)據(jù)和與其關(guān)聯(lián)的臨床數(shù)據(jù),為挖掘有意義的組學(xué)變化和發(fā)現(xiàn)腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移等生物學(xué)機(jī)制提供了海量數(shù)據(jù)。美國(guó)的SEER(癌癥監(jiān)測(cè)、流行病學(xué)和結(jié)果)數(shù)據(jù)庫(kù)是較為典型的臨床醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),由美國(guó)國(guó)立癌癥研究所(National Cancer Institute,NCI)于1973 年所建立,其后每年定期更新,是北美最具代表性的大型腫瘤登記注冊(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)之一,收集了各個(gè)癌種的臨床病理信息和預(yù)后數(shù)據(jù),并向全世界免費(fèi)開(kāi)放,為臨床醫(yī)師的循證實(shí)踐及臨床研究提供了寶貴的第一手資料。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),全世界基于TCGA和SEER數(shù)據(jù)挖掘產(chǎn)生的文章已經(jīng)超過(guò)2000篇,其中不乏最頂尖的學(xué)術(shù)期刊文章,這一數(shù)目還在不斷增長(zhǎng)中。
傳統(tǒng)的臨床醫(yī)生和科研工作者缺乏相關(guān)知識(shí)基礎(chǔ)來(lái)處理這些癌癥大數(shù)據(jù),因而在面對(duì)這些極有價(jià)值的組學(xué)和臨床數(shù)據(jù)時(shí),往往心有余而力不足。本課程將從臨床應(yīng)用視角介紹TCGA、SEER及其他癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的基本情況、數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)、獲取方式及基本統(tǒng)計(jì)方法等,深度解析近年來(lái)國(guó)內(nèi)外基于TCGA和SEER數(shù)據(jù)的經(jīng)典分析案例,重點(diǎn)對(duì)癌癥公共數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)挖掘和課題設(shè)計(jì)進(jìn)行討論,最后也將探討在此基礎(chǔ)上的基金申請(qǐng)、SCI論文撰寫(xiě)策略。
本次主講老師是來(lái)自國(guó)內(nèi)知名三甲醫(yī)院腫瘤專(zhuān)業(yè)的臨床醫(yī)生和科研工作者,有著豐富的臨床和轉(zhuǎn)化研究經(jīng)驗(yàn),成功用TCGA、SEER數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表十幾篇SCI,平均影響因子4.6分一篇。
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責(zé)任編輯:武偉偉
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