形成咸潮的原因有以下幾點：
降水少是主要原因
由于2003年全流域降雨比多年平均減少2成以上。廣州市番禺區(qū)沙灣水道上游西江流域減少6成，加上2004年入冬以來降雨銳減，導致南粵各地江、湖、庫水位急劇下降，2005年咸潮發(fā)生時廣東省30座大型水庫總蓄水量為11048.4百萬立方米，比干旱的2003年同期減少3363.6百萬立方米，減幅為23%。降雨減少導致江河流量嚴重減少，2005年初西江高要站的水位為-0.06米。珠江上游少雨，源水水量減少，下游則受海水潮汐影響，形成咸潮。咸潮的直接誘因就是南粵大地連年干旱。
珠江無序挖沙
整個珠江口的年平均沙量是8000萬噸，這個數(shù)字是包括懸浮在水里的泥沙的，而沉在河底的粗沙只占總量的5%~6%，人們挖走的泥沙部分都是粗沙，而且開采量已經(jīng)連續(xù)15年超過了8000萬噸，這就把歷史上積存的河沙也挖盡了，而且上游的泥沙不夠補夠補充已被挖走的河沙。
咸潮主要是自然原因造成的。但是近幾年來，廣東沿海咸潮頻繁發(fā)生，是有人類活動的影響的。這些年，廣東省濫采河砂行為愈演愈烈，致使江河下游河床坡度減小，導致咸潮上溯的范圍擴大、次數(shù)增多。
咸潮來臨時，對居民生活、工業(yè)生產(chǎn)以至農(nóng)業(yè)灌溉都有相當大的影響。自來水會變得咸苦，難以飲用;長時期飲用氯化物含量多的水對人體健康危害較大。工業(yè)生產(chǎn)使用含鹽分多的水會損害機器設備;農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上，使用咸水灌溉農(nóng)田，會導致農(nóng)作物萎蔫甚至死亡。因此，應及時做好應對準備工作，保障城鄉(xiāng)居民供水，廣大群眾也應注意節(jié)約用水。
咸潮往往給沿海地區(qū)居民生活及工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)用水造成不良影響，應對咸潮的策略主要是輸?shù)瓊渌斑\用蓄水工程如水庫等避咸。
咸潮對珠江三角洲的影響:珠江三角洲地區(qū)河道縱橫交錯，受徑流和潮流共同影響，水流往復回蕩，易受咸潮威脅。咸潮上溯已成為珠江河口地區(qū)嚴重的環(huán)境問題之一，水中的鹽度高還會對企業(yè)生產(chǎn)造成威脅，生產(chǎn)設備容易氧化，鍋爐容易積垢。在咸潮災害中，生產(chǎn)中用水量較大的化學原料及化學制品制造、金屬制品、紡織服裝等產(chǎn)業(yè)受到的沖擊較大，其中一些企業(yè)不得不停產(chǎn)。
咸潮多發(fā)于河流的枯水期，這時河流水位較低，海水比較容易倒灌入河。我國大部分地區(qū)屬季風氣候，降水有明顯的季節(jié)變化。旱季時，河流處于枯水期，咸潮影響明顯增強。若遇到大旱年份，咸潮危害更大。風對咸潮影響也比較大。若風向與海潮方向一致，可以加快咸潮推進的速度，擴大它的影響范圍。全球變暖導致海平面上升是一個非常緩慢的過程，但長期的累積效應也非常明顯，使得咸潮影響到更廣的地區(qū)。
咸潮還會造成地下水和土壤內(nèi)的鹽度升高，給"魚米之鄉(xiāng)"的珠三角農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成嚴重影響，危害到當?shù)氐闹参锷?。從廣州市番禺區(qū)農(nóng)村看到的情況令人觸目驚心。在番禺石樓鎮(zhèn)的一些稻田邊，盡管水溝里蓄有一些水，然而田地卻龜裂著。該鎮(zhèn)因為咸潮，溝里的水咸度已達0.5%，而如果農(nóng)作物"飲用"咸度超過0.4%的水，半個月后就會停止生長，甚至死掉。
折疊建立預警機制
加強對咸潮形成機理的研究，運用先進的超聲波流速剖面儀等設備和技術(shù)，對咸潮實施同步的嚴密監(jiān)測，并建立預警機制，建立協(xié)調(diào)機構(gòu)，在咸潮到來之前做好防范。如2004年9月中旬和10月上旬珠江口出現(xiàn)歷史罕見提前來臨的咸潮，先后襲擊了珠海、中山之后，廣東省水利、三防、水文部門就提前介入了咸潮的預測、預報、預警。這樣，對罕見的咸潮入侵就應對自如、有條不紊一、秩序井然。
采取調(diào)水以淡壓咸
由于咸潮活動主要受潮汐活動和上游來水控制。潮汐活動可調(diào)節(jié)的余地有限，而上游徑流的調(diào)節(jié)則是大有可為的。進入21世紀，抵御咸潮迫切要求水利樞紐的運作。調(diào)水以淡壓咸是現(xiàn)在比較有效的應急辦法。專家介紹說，珠江水系中西江大部分水電站的調(diào)節(jié)庫容較小、能力有限，且比較分散，因此，應急調(diào)水壓咸調(diào)度應以西江干流天牛橋一級、巖灘水庫為主，鑒于北江飛來峽距離珠江三角洲較近、流程約1~2天，也應當優(yōu)先考慮其調(diào)水壓咸作用，通過調(diào)水以淡壓咸可以允分發(fā)揮大珠江流域水資源的綜合效益。
