我們把生活在土壤中的微生物、動物和植物等總稱為土壤生物。土壤生物參與巖石的風化和原始土壤的生成，對土壤的生長發(fā)育、土壤肥力的形成和演變，以及高等植物營養(yǎng)供應狀況有重要作用。土壤物理性質(zhì)、化學性質(zhì)和農(nóng)業(yè)技術措施，對土壤生物的生命活動有很大影響。

土壤中這些豐富的生物類群，是一個重要的地下生物資源庫，它除參與巖石的風化和原始土壤的生成外，對土壤的生長和發(fā)育、土壤肥力的形成和演變以及高等植物的營養(yǎng)供應狀況均有重要作用。土壤生物尤其是微生物對陸地動植物殘體的分解、土壤結(jié)構形成、有機物轉(zhuǎn)化、有毒物質(zhì)的降解等至關重要，同時對環(huán)境起著天然的過濾和凈化作用。有機農(nóng)業(yè)充分肯定土壤活性的重要性，土壤活性主要體現(xiàn)在土壤生物的活性和多樣性。

土壤中的生物是多種多樣的，其中土壤微生物(包括細菌、放線菌、真菌、藻類和原生動物等)是土壤中重要的分解者，在土壤的形成和發(fā)展過程中起著重要的作用。在土壤形成的初級階段，能利用光能的地衣類微生物參與巖石的風化，再在其他微生物的參與下，形成腐殖質(zhì)使土壤性質(zhì)發(fā)生變化。

土壤動物是最重要的消費者和分解者。在土壤中生存或棲居的動物有上千種，很多為節(jié)肢動物。非節(jié)肢土壤動物主要有線蟲和蚯蚓。線蟲是土壤中存在比較豐富的動物，主要生活在土粒周圍的水膜中或植物根內(nèi)。土壤中寄生性線蟲寄生于許多植物根部。蚯蚓是土壤中最常見的生物，喜歡濕潤的環(huán)境和豐富的有機質(zhì)，常生活在黏質(zhì)、有機質(zhì)含量高和酸性不太強的土壤里，有人估計，每公頃土壤所含蚯蚓可達200～1000千克。蚯蚓靠吞食土壤中的有機物質(zhì)生活，它們使土壤與有機物緊密混合，并通過孔道的形成、糞粒的產(chǎn)生，使土壤更疏松多孔。

首先我們知道，在土壤中有許多微生物，而在土壤中的這些微生物，各個之間又相互作用，形成了一個較為和諧穩(wěn)定的生態(tài)圈。那么在健康的土壤環(huán)境條件下，土壤中有有害菌，同時也有無害菌。而這兩大軍種也處于一個相對平衡的狀態(tài)。但是隨著我們在后期不斷的對土壤進行施肥施料，不斷加入新的離子進行與土壤中的一些微生物作用之后，就會發(fā)現(xiàn)土壤中這兩種菌種，呈現(xiàn)一個失調(diào)的現(xiàn)象，有害菌種的數(shù)量會不斷的上漲，而無害菌種也會急劇減少。

那么這就會直接導致了我們土壤的生物性質(zhì)發(fā)生病變。那么隨之而來的影響作用就是導致，果園中的果樹不能夠進行正常的生理活動，不能夠順利的成長，進而導致果園中后期的產(chǎn)品數(shù)量提高不上來。所以說果然土壤中的生物性質(zhì)的惡化是導致果園減產(chǎn)的主要原因之一。

土壤微生物包括細菌、放線菌、真菌、藻類和原生動物 5大類群。當然我們所說的土壤生物菌指的也就是前三項。

細菌 　單細胞生物。個體直徑0.5～2微米,長度1～8微米。按體形分球菌、桿菌和螺旋菌;按營養(yǎng)類型分自養(yǎng)細菌和異養(yǎng)細菌。按呼吸類型分好氣性細菌、嫌氣性細菌和兼性細菌。細菌參與新鮮有機質(zhì)的分解，對蛋白質(zhì)的分解能力尤強（氨化細菌）；并參與硫、鐵、錳的轉(zhuǎn)化和固氮作用。每克表層土壤中約含細菌幾百萬至幾千萬個，是土壤菌類中數(shù)量最多的一個類群。

放線菌 　單細胞生物，呈纖細的菌絲狀。菌絲直徑0.5～2微米。土壤中常見的有鏈霉菌屬(Streptomyces)放線菌屬(Actinomyces)、諾卡菌屬 (Nocardia)和小單孢菌屬(Micromonospora)等。放線菌具有分解植物殘體和轉(zhuǎn)化碳、氮、磷化合物的能力。某些放線菌還能產(chǎn)生抗生素，是許多醫(yī)用和農(nóng)用抗生素的產(chǎn)生菌。每克表層土壤約含放線菌幾十萬至幾千萬個，是數(shù)量上僅次于細菌的一個類群。

土壤生物污染是指病原體和帶病等有害生物種群從外界侵入土壤，破壞土壤生態(tài)系統(tǒng)的平衡，引起土壤質(zhì)量下降的現(xiàn)象。有害生物種群來源是用未經(jīng)處理的人畜糞便施肥、生活污水、垃圾、醫(yī)院含有病原體的污水和工業(yè)廢水(作農(nóng)田灌溉或作為底泥施肥)，以及病畜尸體處理不當?shù)取?

土壤生物污染物的來源

由于人類的生活和生產(chǎn)活動將大量有害廢物、污水向土壤表面堆放和傾倒，大氣中的有害氣體及飄塵也不斷隨雨水降落在土壤中，這不僅引起土壤化學污染，也引起土壤環(huán)境生物污染。

污水灌溉

未經(jīng)處理的城市生活污水、飼養(yǎng)場和屠宰場廢水、醫(yī)院污水可能攜帶大量病原微生物和寄生蟲卵，灌溉時即可污染土壤及蔬菜。1985年我國某市郊區(qū)蔬菜地土壤中，污灌區(qū)、清污輪灌區(qū)和清灌區(qū)每克土中檢出大腸菌群數(shù)平均值分別為1495個、1495個和1273個；在污灌區(qū)、清污輪灌區(qū)每克土中檢出蠕蟲卵分別為4.5個和6.2個，屬于強烈污染。

土壤生物修復技術主要分為：植物修復技術、動物修復技術、微生物修復技術三大類。

土壤植物修復技術是根據(jù)植物可耐受或超積累某些特定化合物的特性，利用綠色植物及其共生微生物提取、轉(zhuǎn)移、吸收、分解、轉(zhuǎn)化或固定土壤中的有機或無機污染物，把污染物從土壤中去除，從而達到移除、削減或穩(wěn)定污染物，或降低污染物毒性等目的。

土壤動物修復技術是一種通過土壤動物直接的吸收、轉(zhuǎn)化和分解或間接的改善土壤理化性質(zhì)，提高土壤肥力，促進植物和微生物的生長等作用，從而達到修復土壤目的的技術。

土壤微生物修復技術是一種利用土著微生物或人工馴化的具有特定功能微生物，在適宜環(huán)境條件下，通過自身的代謝作用，降低有害污染物活性或降解成無害物質(zhì)的修復技術。